蝇类防治是水灾过后的首要防治对象，由于人员的疏散转移和集中安置，容易造成垃圾的大量堆积，此外由于水灾的影响，还有可能造成大量动物的死亡，动物尸体和集中堆积的垃圾无法及时清理，灾后高温高湿的环境下也极容易变质腐烂，而蝇类很容易在垃圾上产卵，丰富的食物与适宜的生存条件，容易造成蝇类的大量孳生。
